Protein–RNA interactions for Protein: Q80T74

Klhl29, Kelch-like protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl29Q80T74 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klhl29Q80T74 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klhl29Q80T74 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klhl29Q80T74 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klhl29Q80T74 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Klhl29Q80T74 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms