Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sgo2Q7TSY8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sgo2Q7TSY8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms