Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

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Length 68 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Pcp4l1Q6W8Q3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Pcp4l1Q6W8Q3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Pcp4l1Q6W8Q3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Pcp4l1Q6W8Q3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Pcp4l1Q6W8Q3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Pcp4l1Q6W8Q3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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