Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casc1Q6TDU8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casc1Q6TDU8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casc1Q6TDU8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casc1Q6TDU8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casc1Q6TDU8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casc1Q6TDU8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casc1Q6TDU8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casc1Q6TDU8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casc1Q6TDU8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casc1Q6TDU8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casc1Q6TDU8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casc1Q6TDU8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casc1Q6TDU8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casc1Q6TDU8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casc1Q6TDU8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casc1Q6TDU8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casc1Q6TDU8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casc1Q6TDU8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casc1Q6TDU8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Casc1Q6TDU8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casc1Q6TDU8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casc1Q6TDU8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casc1Q6TDU8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms