Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Atg16l2Q6KAU8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Atg16l2Q6KAU8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms