Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp4Q68FH0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp4Q68FH0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp4Q68FH0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp4Q68FH0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp4Q68FH0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp4Q68FH0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp4Q68FH0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pkp4Q68FH0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp4Q68FH0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp4Q68FH0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp4Q68FH0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp4Q68FH0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp4Q68FH0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp4Q68FH0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp4Q68FH0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp4Q68FH0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp4Q68FH0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp4Q68FH0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp4Q68FH0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp4Q68FH0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp4Q68FH0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp4Q68FH0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp4Q68FH0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp4Q68FH0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp4Q68FH0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp4Q68FH0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp4Q68FH0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp4Q68FH0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp4Q68FH0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp4Q68FH0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp4Q68FH0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp4Q68FH0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pkp4Q68FH0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp4Q68FH0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp4Q68FH0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp4Q68FH0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp4Q68FH0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp4Q68FH0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp4Q68FH0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp4Q68FH0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp4Q68FH0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp4Q68FH0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms