Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ctnna3Q65CL1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctnna3Q65CL1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnna3Q65CL1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms