Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nptx1Q62443 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nptx1Q62443 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms