Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rbm38Q62176 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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