Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phox2aQ62066 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phox2aQ62066 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phox2aQ62066 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2aQ62066 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2aQ62066 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phox2aQ62066 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms