Protein–RNA interactions for Protein: Q61189

Clns1a, Methylosome subunit pICln, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clns1aQ61189 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clns1aQ61189 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clns1aQ61189 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clns1aQ61189 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clns1aQ61189 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clns1aQ61189 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clns1aQ61189 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clns1aQ61189 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clns1aQ61189 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clns1aQ61189 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clns1aQ61189 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clns1aQ61189 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clns1aQ61189 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clns1aQ61189 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clns1aQ61189 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clns1aQ61189 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clns1aQ61189 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clns1aQ61189 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clns1aQ61189 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clns1aQ61189 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clns1aQ61189 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clns1aQ61189 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clns1aQ61189 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clns1aQ61189 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Clns1aQ61189 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms