Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf4Q60793 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf4Q60793 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf4Q60793 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms