Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rabl6Q5U3K5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rabl6Q5U3K5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms