Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZT6

Zkscan4, MCG23028, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan4Q5SZT6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zkscan4Q5SZT6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Zkscan4Q5SZT6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zkscan4Q5SZT6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zkscan4Q5SZT6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zkscan4Q5SZT6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms