Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Trappc1Q5NCF2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trappc1Q5NCF2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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