Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prkaa1Q5EG47 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prkaa1Q5EG47 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms