Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prpf38aQ4FK66 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Prpf38aQ4FK66 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpf38aQ4FK66 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpf38aQ4FK66 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpf38aQ4FK66 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpf38aQ4FK66 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpf38aQ4FK66 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpf38aQ4FK66 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpf38aQ4FK66 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpf38aQ4FK66 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpf38aQ4FK66 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpf38aQ4FK66 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prpf38aQ4FK66 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prpf38aQ4FK66 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prpf38aQ4FK66 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prpf38aQ4FK66 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms