Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnpc3Q3UZ01 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnpc3Q3UZ01 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnpc3Q3UZ01 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnpc3Q3UZ01 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnpc3Q3UZ01 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnpc3Q3UZ01 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnpc3Q3UZ01 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnpc3Q3UZ01 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnpc3Q3UZ01 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnpc3Q3UZ01 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnpc3Q3UZ01 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnpc3Q3UZ01 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnpc3Q3UZ01 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnpc3Q3UZ01 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnpc3Q3UZ01 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnpc3Q3UZ01 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnpc3Q3UZ01 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnpc3Q3UZ01 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnpc3Q3UZ01 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnpc3Q3UZ01 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnpc3Q3UZ01 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnpc3Q3UZ01 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnpc3Q3UZ01 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnpc3Q3UZ01 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnpc3Q3UZ01 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnpc3Q3UZ01 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnpc3Q3UZ01 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnpc3Q3UZ01 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnpc3Q3UZ01 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnpc3Q3UZ01 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnpc3Q3UZ01 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnpc3Q3UZ01 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnpc3Q3UZ01 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnpc3Q3UZ01 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnpc3Q3UZ01 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnpc3Q3UZ01 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnpc3Q3UZ01 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnpc3Q3UZ01 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnpc3Q3UZ01 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnpc3Q3UZ01 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnpc3Q3UZ01 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnpc3Q3UZ01 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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