Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc160Q3UYG1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc160Q3UYG1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms