Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Fchsd2Q3USJ8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Fchsd2Q3USJ8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms