Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc61Q3UJV1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc61Q3UJV1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms