Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI4

Tmed8, Protein TMED8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed8Q3UHI4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmed8Q3UHI4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed8Q3UHI4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed8Q3UHI4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed8Q3UHI4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed8Q3UHI4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed8Q3UHI4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed8Q3UHI4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed8Q3UHI4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed8Q3UHI4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed8Q3UHI4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed8Q3UHI4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed8Q3UHI4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmed8Q3UHI4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmed8Q3UHI4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmed8Q3UHI4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmed8Q3UHI4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmed8Q3UHI4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmed8Q3UHI4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmed8Q3UHI4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmed8Q3UHI4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmed8Q3UHI4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmed8Q3UHI4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmed8Q3UHI4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed8Q3UHI4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed8Q3UHI4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed8Q3UHI4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed8Q3UHI4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed8Q3UHI4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed8Q3UHI4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed8Q3UHI4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed8Q3UHI4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed8Q3UHI4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed8Q3UHI4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed8Q3UHI4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed8Q3UHI4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed8Q3UHI4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed8Q3UHI4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed8Q3UHI4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed8Q3UHI4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed8Q3UHI4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed8Q3UHI4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmed8Q3UHI4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmed8Q3UHI4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms