Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5F4

Yrdc, YrdC domain-containing protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YrdcQ3U5F4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
YrdcQ3U5F4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.08■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.08■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.07■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
YrdcQ3U5F4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms