Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VrtnQ3SYK4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VrtnQ3SYK4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VrtnQ3SYK4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms