Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cpne9Q1RLL3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne9Q1RLL3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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