Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLPPQ16740 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLPPQ16740 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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