Protein–RNA interactions for Protein: Q12477

PCL9, PHO85 cyclin-9, yeastyeast

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PCL9Q12477 VAS1YGR094W 3315 nt2.58□□□□□ -2
PCL9Q12477 MRH1YDR033W 963 nt2.58□□□□□ -2
PCL9Q12477 YDR262WYDR262W 819 nt2.58□□□□□ -2
PCL9Q12477 RSM18YER050C 417 nt2.58□□□□□ -2
PCL9Q12477 PGD1YGL025C 1194 nt2.58□□□□□ -2
PCL9Q12477 RPL11BYGR085C 525 nt2.58□□□□□ -2
PCL9Q12477 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt2.58□□□□□ -2
PCL9Q12477 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt2.58□□□□□ -2
PCL9Q12477 YKL091CYKL091C 933 nt2.58□□□□□ -2
PCL9Q12477 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt2.58□□□□□ -2
PCL9Q12477 TPK2YPL203W 1143 nt2.58□□□□□ -2
PCL9Q12477 RPL11AYPR102C 525 nt2.58□□□□□ -2
PCL9Q12477 ADF1YCL058W-A 342 nt2.58□□□□□ -2
PCL9Q12477 BNA4YBL098W 1383 nt2.58□□□□□ -2
PCL9Q12477 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.58□□□□□ -2
PCL9Q12477 LST4YKL176C 2487 nt2.57□□□□□ -2
PCL9Q12477 SLK19YOR195W 2466 nt2.57□□□□□ -2
PCL9Q12477 YPR1YDR368W 939 nt2.57□□□□□ -2
PCL9Q12477 YGR107WYGR107W 450 nt2.57□□□□□ -2
PCL9Q12477 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt2.57□□□□□ -2
PCL9Q12477 TDA8YAL064C-A 381 nt2.57□□□□□ -2
PCL9Q12477 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.57□□□□□ -2
PCL9Q12477 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.57□□□□□ -2
PCL9Q12477 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.57□□□□□ -2
PCL9Q12477 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.57□□□□□ -2
PCL9Q12477 RUF5-1RUF5-1 710 nt2.57□□□□□ -2
PCL9Q12477 RUF5-2RUF5-2 710 nt2.57□□□□□ -2
PCL9Q12477 CSI2YOL007C 1026 nt2.57□□□□□ -2
PCL9Q12477 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt2.57□□□□□ -2
PCL9Q12477 TAZ1YPR140W 1146 nt2.57□□□□□ -2
PCL9Q12477 YCL002CYCL002C 792 nt2.57□□□□□ -2
PCL9Q12477 RRM3YHR031C 2172 nt2.56□□□□□ -2
PCL9Q12477 SNA4YDL123W 423 nt2.56□□□□□ -2
PCL9Q12477 YDR248CYDR248C 582 nt2.56□□□□□ -2
PCL9Q12477 DYN2YDR424C 279 nt2.56□□□□□ -2
PCL9Q12477 PNC1YGL037C 651 nt2.56□□□□□ -2
PCL9Q12477 SAE2YGL175C 1038 nt2.56□□□□□ -2
PCL9Q12477 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt2.56□□□□□ -2
PCL9Q12477 YIL174WYIL174W 228 nt2.56□□□□□ -2
PCL9Q12477 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.56□□□□□ -2
PCL9Q12477 YET1YKL065C 621 nt2.56□□□□□ -2
PCL9Q12477 LIP2YLR239C 987 nt2.56□□□□□ -2
PCL9Q12477 YAR069CYAR069C 294 nt2.56□□□□□ -2
PCL9Q12477 ECI1YLR284C 843 nt2.56□□□□□ -2
PCL9Q12477 YNL203CYNL203C 612 nt2.56□□□□□ -2
PCL9Q12477 YPL142CYPL142C 318 nt2.56□□□□□ -2
PCL9Q12477 TIM12YBR091C 330 nt2.56□□□□□ -2
PCL9Q12477 SUS1YBR111W-A 291 nt2.56□□□□□ -2
PCL9Q12477 SWD3YBR175W 948 nt2.56□□□□□ -2
PCL9Q12477 NTC20YBR188C 423 nt2.56□□□□□ -2
PCL9Q12477 NSA1YGL111W 1392 nt2.56□□□□□ -2
PCL9Q12477 YLR108CYLR108C 1458 nt2.56□□□□□ -2
PCL9Q12477 YME2YMR302C 2553 nt2.55□□□□□ -2
PCL9Q12477 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt2.55□□□□□ -2
PCL9Q12477 AVT2YEL064C 1443 nt2.55□□□□□ -2
PCL9Q12477 YIP1YGR172C 747 nt2.55□□□□□ -2
PCL9Q12477 PCL5YHR071W 690 nt2.55□□□□□ -2
PCL9Q12477 AIM18YHR198C 966 nt2.55□□□□□ -2
PCL9Q12477 GIM5YML094W 492 nt2.55□□□□□ -2
PCL9Q12477 SKO1YNL167C 1944 nt2.55□□□□□ -2
PCL9Q12477 YOR152CYOR152C 771 nt2.55□□□□□ -2
PCL9Q12477 MBA1YBR185C 837 nt2.55□□□□□ -2
PCL9Q12477 MAK5YBR142W 2322 nt2.54□□□□□ -2
PCL9Q12477 HOP1YIL072W 1818 nt2.54□□□□□ -2
PCL9Q12477 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.54□□□□□ -2
PCL9Q12477 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.54□□□□□ -2
PCL9Q12477 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.54□□□□□ -2
PCL9Q12477 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.54□□□□□ -2
PCL9Q12477 YER138CYER138C 5268 nt2.54□□□□□ -2
PCL9Q12477 YER160CYER160C 5268 nt2.54□□□□□ -2
PCL9Q12477 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.54□□□□□ -2
PCL9Q12477 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.54□□□□□ -2
PCL9Q12477 YJR027WYJR027W 5268 nt2.54□□□□□ -2
PCL9Q12477 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.54□□□□□ -2
PCL9Q12477 YML039WYML039W 5268 nt2.54□□□□□ -2
PCL9Q12477 YML045WYML045W 5268 nt2.54□□□□□ -2
PCL9Q12477 YMR050CYMR050C 5268 nt2.54□□□□□ -2
PCL9Q12477 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.54□□□□□ -2
PCL9Q12477 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.54□□□□□ -2
PCL9Q12477 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.54□□□□□ -2
PCL9Q12477 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.54□□□□□ -2
PCL9Q12477 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.54□□□□□ -2
PCL9Q12477 STP2YHR006W 1626 nt2.54□□□□□ -2
PCL9Q12477 ANR2YKL047W 1551 nt2.54□□□□□ -2
PCL9Q12477 ADY4YLR227C 1482 nt2.54□□□□□ -2
PCL9Q12477 YDR042CYDR042C 603 nt2.54□□□□□ -2
PCL9Q12477 YGL159WYGL159W 1113 nt2.54□□□□□ -2
PCL9Q12477 YGR160WYGR160W 612 nt2.54□□□□□ -2
PCL9Q12477 RPS22AYJL190C 393 nt2.54□□□□□ -2
PCL9Q12477 REC102YLR329W 795 nt2.54□□□□□ -2
PCL9Q12477 RPL23AYBL087C 414 nt2.54□□□□□ -2
PCL9Q12477 MRPL40YPL173W 894 nt2.54□□□□□ -2
PCL9Q12477 snR189snR189 189 nt2.54□□□□□ -2
PCL9Q12477 SEC66YBR171W 621 nt2.54□□□□□ -2
PCL9Q12477 URB2YJR041C 3525 nt2.54□□□□□ -2
PCL9Q12477 RIM13YMR154C 2184 nt2.54□□□□□ -2
PCL9Q12477 EAP1YKL204W 1899 nt2.54□□□□□ -2
PCL9Q12477 TOM70YNL121C 1854 nt2.54□□□□□ -2
PCL9Q12477 KHA1YJL094C 2622 nt2.54□□□□□ -2
PCL9Q12477 MED1YPR070W 1701 nt2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.7 ms