Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cnn1Q08091 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms