Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cab39Q06138 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cab39Q06138 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms