Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cds1P98191 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cds1P98191 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cds1P98191 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cds1P98191 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cds1P98191 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cds1P98191 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cds1P98191 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cds1P98191 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cds1P98191 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cds1P98191 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cds1P98191 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cds1P98191 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms