Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rps3aP97351 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps3aP97351 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms