Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx2P81066 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx2P81066 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Irx2P81066 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx2P81066 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx2P81066 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms