Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

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Length 162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UbdP63072 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UbdP63072 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UbdP63072 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UbdP63072 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
UbdP63072 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UbdP63072 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UbdP63072 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UbdP63072 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UbdP63072 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UbdP63072 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UbdP63072 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UbdP63072 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UbdP63072 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UbdP63072 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UbdP63072 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UbdP63072 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UbdP63072 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UbdP63072 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UbdP63072 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UbdP63072 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UbdP63072 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UbdP63072 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UbdP63072 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UbdP63072 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UbdP63072 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UbdP63072 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UbdP63072 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
UbdP63072 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UbdP63072 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UbdP63072 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UbdP63072 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
UbdP63072 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UbdP63072 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UbdP63072 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UbdP63072 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UbdP63072 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UbdP63072 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UbdP63072 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UbdP63072 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UbdP63072 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UbdP63072 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UbdP63072 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UbdP63072 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UbdP63072 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UbdP63072 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UbdP63072 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UbdP63072 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UbdP63072 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UbdP63072 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UbdP63072 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UbdP63072 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UbdP63072 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UbdP63072 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UbdP63072 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UbdP63072 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
UbdP63072 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
UbdP63072 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbdP63072 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbdP63072 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbdP63072 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
UbdP63072 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbdP63072 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbdP63072 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbdP63072 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbdP63072 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbdP63072 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbdP63072 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbdP63072 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbdP63072 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbdP63072 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbdP63072 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbdP63072 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbdP63072 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
UbdP63072 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbdP63072 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbdP63072 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbdP63072 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbdP63072 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbdP63072 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbdP63072 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbdP63072 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbdP63072 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbdP63072 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbdP63072 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbdP63072 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbdP63072 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbdP63072 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbdP63072 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbdP63072 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbdP63072 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UbdP63072 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UbdP63072 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UbdP63072 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UbdP63072 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UbdP63072 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UbdP63072 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UbdP63072 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UbdP63072 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UbdP63072 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms