Protein–RNA interactions for Protein: P63011

Rab3a, Ras-related protein Rab-3A, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3aP63011 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab3aP63011 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab3aP63011 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms