Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Snrpd1P62315 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Snrpd1P62315 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms