Protein–RNA interactions for Protein: P62141

Ppp1cb, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-beta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1cbP62141 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppp1cbP62141 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppp1cbP62141 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppp1cbP62141 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppp1cbP62141 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppp1cbP62141 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppp1cbP62141 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppp1cbP62141 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppp1cbP62141 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppp1cbP62141 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppp1cbP62141 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppp1cbP62141 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms