Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smpdl3bP58242 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Smpdl3bP58242 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpdl3bP58242 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpdl3bP58242 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpdl3bP58242 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpdl3bP58242 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpdl3bP58242 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpdl3bP58242 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpdl3bP58242 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpdl3bP58242 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpdl3bP58242 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpdl3bP58242 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpdl3bP58242 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpdl3bP58242 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smpdl3bP58242 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpdl3bP58242 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpdl3bP58242 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpdl3bP58242 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpdl3bP58242 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpdl3bP58242 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpdl3bP58242 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smpdl3bP58242 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms