Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn18P56857 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cldn18P56857 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms