Protein–RNA interactions for Protein: P54254

Atxn1, Ataxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn1P54254 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atxn1P54254 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atxn1P54254 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atxn1P54254 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atxn1P54254 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atxn1P54254 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atxn1P54254 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atxn1P54254 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atxn1P54254 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atxn1P54254 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atxn1P54254 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atxn1P54254 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atxn1P54254 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atxn1P54254 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atxn1P54254 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atxn1P54254 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atxn1P54254 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atxn1P54254 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atxn1P54254 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atxn1P54254 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atxn1P54254 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atxn1P54254 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms