Protein–RNA interactions for Protein: P53994

Rab2a, Ras-related protein Rab-2A, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2aP53994 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab2aP53994 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab2aP53994 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms