Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ApodP51910 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ApodP51910 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ApodP51910 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ApodP51910 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ApodP51910 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ApodP51910 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ApodP51910 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ApodP51910 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ApodP51910 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ApodP51910 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ApodP51910 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ApodP51910 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ApodP51910 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ApodP51910 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ApodP51910 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ApodP51910 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ApodP51910 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ApodP51910 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ApodP51910 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ApodP51910 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ApodP51910 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ApodP51910 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ApodP51910 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ApodP51910 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ApodP51910 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ApodP51910 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ApodP51910 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ApodP51910 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ApodP51910 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ApodP51910 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ApodP51910 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ApodP51910 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ApodP51910 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ApodP51910 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ApodP51910 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ApodP51910 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ApodP51910 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ApodP51910 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ApodP51910 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ApodP51910 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ApodP51910 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ApodP51910 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ApodP51910 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ApodP51910 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ApodP51910 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ApodP51910 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ApodP51910 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ApodP51910 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ApodP51910 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ApodP51910 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ApodP51910 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ApodP51910 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ApodP51910 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ApodP51910 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ApodP51910 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ApodP51910 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ApodP51910 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ApodP51910 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ApodP51910 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ApodP51910 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ApodP51910 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ApodP51910 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ApodP51910 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ApodP51910 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ApodP51910 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ApodP51910 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ApodP51910 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ApodP51910 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ApodP51910 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ApodP51910 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ApodP51910 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ApodP51910 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ApodP51910 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ApodP51910 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ApodP51910 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ApodP51910 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ApodP51910 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ApodP51910 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ApodP51910 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ApodP51910 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ApodP51910 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ApodP51910 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ApodP51910 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ApodP51910 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ApodP51910 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ApodP51910 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ApodP51910 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ApodP51910 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ApodP51910 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ApodP51910 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ApodP51910 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ApodP51910 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ApodP51910 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ApodP51910 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ApodP51910 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ApodP51910 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ApodP51910 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ApodP51910 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ApodP51910 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms