Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gpc4P51655 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gpc4P51655 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gpc4P51655 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms