Protein–RNA interactions for Protein: P50220

Nkx2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-1P50220 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nkx2-1P50220 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms