Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ercc3P49135 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ercc3P49135 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms