Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tac1P41539 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tac1P41539 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tac1P41539 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tac1P41539 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tac1P41539 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tac1P41539 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tac1P41539 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tac1P41539 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms