Protein–RNA interactions for Protein: P35293

Rab18, Ras-related protein Rab-18, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab18P35293 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab18P35293 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab18P35293 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab18P35293 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab18P35293 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab18P35293 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab18P35293 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab18P35293 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab18P35293 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms