Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ggta1P23336 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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Ggta1P23336 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Ggta1P23336 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ggta1P23336 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms