Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pou5f1P20263 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou5f1P20263 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms