Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ntf3P20181 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms