Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rpl13aP19253 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl13aP19253 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms